Quando morei na Alemanha, minha namorada foi me visitar praticamente no mesmo período em que vocês viajam (ela chegou antes no natal e voltou dia 15/01 mesmo). Passamos o natal em Praga, depois fomos pra Amsterdã, ano novo em Londres -> Budapeste -> Istambul -> Roma.
Praga foi legal. Estava nevando, mas não chegou a atrapalhar os planos. Conseguimos passear bastante, subir no Castelo em dois dias diferentes e conhecer a cidade. O problema é que fica tudo meio cinza e os dias são curtos. Acho melhor no verão.
Não gostei muito de Amsterdã no inverno (e nem no verão, na verdade), mas já que vocês chegam lá, tentem ficar uns dois dias. Estava bem frio, com alguns canais congelados e bastante vento.
Virado do ano em Londres é bem legal, grande concentração perto da London Eye e show de fogos de artifício. A cidade tem muitas atrações também, então não fica prejudicada pelo frio, e normalmente não neva. É uma cidade bem cara e a hospedagem na época do ano novo estava BEM cara. É bom já irem procurando hospedagem.
Budapeste eu não recomendo no inverno. Estava MUITO frio, muito mesmo, impossibilitando passeios ao ar livre. Achei até bonita, mas voltei no verão e é outra cidade, muito mais legal, com diversas opções de caminhadas agradáveis.
Istambul é demais. Uma das minhas cidades preferidas. Saímos de Budapeste e viajamos pra lá com uma low cost (WizzAir) e foi maravilhoso. Do gelo de Budapeste pro sol de Istambul. Demos muita sorte mesmo, porque o tempo estava ótimo e pudemos conhecer tudo praticamente só caminhando, além de ter sido possível fazer passeios de barco pelo Bósforo. Melhor cidade da nossa viagem. Voltei no verão e choveu direto por três dias. Também é mais barata que as capitais mais mainstream.
Roma também foi ótimo. Bem ensolarada, apesar de um pouco fria. Como vocês voltam por lá, não tem mistério. Acho que ficamos 5 dias, e foi bom para uma primeira visita.
A Alemanha é interessante antes do natal, com as feirinhas típicas em praticamente todas as cidades (os Weihnachtsmärkte). Depois disso, esse período de inverno é bem sem graça. Acho que não vale muito a pena, a não ser que haja um interesse muito grande por alguma cidade ou região.
O maior problema de viajar no inverno é que também depende muito da sorte com o tempo, então é bom sempre pensar nas atrações fechadas, caso chova ou neve muito.
(De 2010/2011, começou a nevar na Alemanha em outubro, e foi praticamente até março. Agora em 2013/2014 não baixou de 0º C, sem um floquinho de neve sequer.)
[Edit] AH! Lembrei agora: se gostarem de cerveja (especial, mas não exclusivamente), recomendo muito passarem pela Bélgica. Bruxelas é muito bonita, tem Bruges pertinho, é fácil de ir de Amsterdã, a comida é boa e as cervejas são maravilhosas.
Isso foi o que lembrei agora. Se puder ajudar em mais alguma coisa, é só falar.